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L'analyse de profilage de l'expression génique est un élément important du processus de développement de médicaments. Il s'agit d'un outil puissant qui peut servir à découvrir la « signature » moléculaire complexe d'une maladie et à fournir des informations capables de déterminer l'efficacité de nouveaux agents thérapeutiques.

Grâce au potentiel de NanoString et d'autres technologies fondées sur la PCR, Labcorp est en mesure d'offrir une variété de services d'analyse de l'expression génique (ADN et ARN) afin de permettre aux chercheurs de disposer d'un aperçu moléculaire du micro-environnement de la tumeur et d'offrir des réponses qui peuvent les aider à prendre des décisions durant les phases précoces de la découverte de molécules en confirmant le mécanisme d'action attendu et l'implication des cibles d'un traitement. Ces services s'appliquent aussi aux études de culture cellulaire durant les recherches sur la preuve de concept avant de passer aux modèles in vivo.

Labcorp propose désormais la technologie ddPCR qui permet de quantifier les acides nucléiques avec une ultrasensibilité et une grande précision grâce au système QX200 de Bio-Rad. La ddPCR permet la quantification absolue de cibles moléculaires indétectables avec les techniques traditionnelles.

Récente addition à la gamme de services de Labcorp, le système d'analyse nCounter® de NanoString et le profileur spatial numérique (DSP) GeoMx® peuvent donner des informations concernant l'impact l'un médicament sur l'expression génique et les voies de signalement qui contrôlent la croissance tumorale.

Le système nCounter® de NanoString permet d'analyser simultanément jusqu'à 800 cibles d'ARN, d'ADN ou de protéine avec un haut niveau de sensibilité et de précision. Le système exploite des « codes-barres » moléculaires et une imagerie dont la résolution va jusqu'à la cellule unique pour quantifier des centaines de transcriptions d'un seul échantillon.

Les autres avantages du système NanoString nCounter® comprennent :

  • Plusieurs « panels standard » d'oncologie (humains et murins) sont disponibles et personnalisables pour inclure jusqu'à 55 cibles uniques supplémentaires.
  • Système optimisé pour les types d'échantillons difficiles (FFPE, tissus, lysates et fluides biologiques)
  • Quantité réduite d'échantillon précieux de matière nécessaire
  • Précis et plus rapide que qPCR (ancune exigence d'amplification) et plus simple que le séquençage nouvelle génération


Bien que le système nCounter® de NanosString fournisse d'excellentes données quantitatives sur les gènes ou les niveaux d'expression protéique à partir d'échantillons de tumeur, le contexte spatial est essentiel pour obtenir plus d'informations sur la biologie des tissus. Le DSP GeoMex® de NanoString est la solution de biologie spatiale, qui peut être utilisée pour mieux comprendre la tumeur et les interactions complexes au sein du micro-environnement de la tumeur.

Outre son utilisation comme service in vivo indépendant pour l'analyse de l'expression génétique à l'aide de modèles cellulaires, la solution NanoString peut être utilisée en environnement ex vivo pour analyser le mécanisme d'action d'un médicament dans les modèles animaux in vivo, offrant ainsi la possibilité d'évaluer plusieurs traitements en vue d'identifier des composés prometteurs.

Nous utilisons un système de PCR en temps réel StepOnePlus™ qui peut lire quatre couleurs différentes dans une plaque à 96 puits et supporte des tests tels que le génotypage de SNP, l'analyse de l'expression des gènes, l'expression du micro-ARN, l'analyse de translocation et la détection des gènes. Nos spécialistes de la PCR peuvent vous aider à déterminer l'expression de gènes spécifiques dans des cellules en culture, des tissus frais ou des tissus congelés. Que vous ayez besoin de mesurer l'expression de gènes dans différentes lignées cellulaires, souches de souris, tissus ou tumeurs, ou de surveiller l'expression de différents gènes avec différents traitements, nos spécialistes de la PCR peuvent vous aider à concevoir une étude adaptée.

Le profilage de l'expression des gènes correspond à la mesure de l'activité (l'expression) de milliers de gènes à la fois pour créer une image globale de la fonction cellulaire. L'ARN est séquencé à l'aide d'un séquençage de nouvelle génération, quantifié et aligné sur des milliers de séquences d'ARN connues provenant de gènes spécifiques. Ces profils peuvent, par exemple, distinguer les cellules qui se divisent activement, montrer comment les cellules réagissent à un traitement particulier ou déterminer quels gènes sont exprimés différemment dans différentes lignées cellulaires, souches de souris, tissus ou tumeurs. Labcorp travaille avec un laboratoire partenaire spécialisé dans le séquençage de l'ARN. Une fois obtenue l'information de séquençage, nous avons le logiciel permettant de quantifier, d'aligner et d'analyser les données. Nous pouvons comparer l'expression de gènes individuels, d'ensembles de gènes apparentés, de groupes de gènes spécifiques à certaines voies ou processus, et de génomes entiers entre les échantillons et afficher les résultats comparatifs sous forme de graphiques et de figures simples.

Accès à une offre personnalisée pour répondre à vos critères en matière d'expression génique

Chez Labcorp, nous associons technologies de pointe et services personnalisés en vue de répondre à vos exigences en matière d'expression génique. Notre équipe ultraspécialisée dispose d'une expérience et d'une expertise en développement, optimisation et validation de lectures d'expression génique durant l'ensemble du processus de découverte de médicament. Nous collaborons étroitement avec vous pour concevoir un flux de travail sur mesure en vue de générer de nombreuses données qui vous aideront à découvrir les mécanismes d'action de vos molécules et les voies de signalement et/ou gènes en amont affectés dans le contexte de la croissance tumorale. Nous sommes fiers d'offrir une large gamme de modèles animaux/tumoraux afin de garantir que nos clients utilisent le modèle qui correspond le mieux à leur projet. Contactez-nous dès aujourd'hui pour discuter des critères de votre étude et du potentiel de nos services d'analyse de l'expression génique pour apporter de nouvelles informations à vos projets de recherche.

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PRÉSENTATION

Le panel nCounter® IO 360™et la cytométrie de flux combinent le transcriptome et des profils immunophénotypiques de sous-ensembles immunitaires pour une analyse complète de l'immunothérapie des tumeurs.

Le profilage transcriptomique peut servir à examiner l'interaction entre le micro-environnement de la tumeur (TME) et le système immunitaire. Il s'agit d'un outil puissant pour étudier le mécanisme d'action des immunothérapies. Dans cette édition de Tech Spotlight, nous allons démontrer comment l'expression génique mesurée dans les tumeurs solides à l'aide du panel nCounter® PanCancer IO 360™ (NanoString Technologies) peut être associée à la cytométrie en flux pour fournir une évaluation complète des effets de l'immunothérapie sur la réponse immunitaire antitumorale.

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